1、洪涝区卫生条件差，特别是饮用水的卫生难以得到保障，首先要预防的是肠道传染病，如霍乱、伤寒、痢疾、甲型肝炎等，因此要注意饮用水、食品、环境卫生、饮用水安全。一是不喝生水、不喝来源不明或被污染的水、不用来源不明或被污染的水漱口、洗菜等，尽量喝烧开的水、瓶装水或经救灾指挥部认可的饮用水（净化设备现场制备或送来的桶装水）；二是不吃被水浸泡的、腐败变质或受潮霉变的食品，不吃淹死病死禽畜；三是注意环境卫生，清扫卫生死角，不随地大小便，垃圾要固定地点堆放；四是缸、桶、盆等盛水器具要经常消毒，消毒后用干净的水冲洗，生熟食品要分开。
2、人畜共患疾病和自然疫源性疾病也是洪涝期间极易发生的，如鼠媒传染病：钩端螺旋体病、流行性出血热；蚊媒传染病：疟疾、流行性乙型脑炎等。防止蚊虫叮咬，晚上睡觉要挂蚊帐，可涂抹防蚊药水、点燃蚊香、电热蚊香片驱避蚊，防蚊防鼠。
3、灾害期间还常见皮肤病，如浸渍性皮炎、虫咬性皮炎等，因此要尽量减少手足在水中浸泡的时间，保持手足部位清洁干燥，涉水时穿防水长筒靴是较好的预防方法。如果皮肤有破损，及时用红药水、酒精、碘伏等消毒，防止感染。
4、灾害期间还应特别注重心理干预，公布咨询电话，对重点人群开展心理疏导和心理危机干预，以消除或减轻焦虑、恐慌等负面情绪。
